Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933416C03RikQ3V063 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4933416C03RikQ3V063 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms