Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SvipQ3UZP4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms