Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp8Q3UD82 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp8Q3UD82 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms