Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd4Q3TT99 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd4Q3TT99 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms