Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms