Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms