Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Calb2Q08331 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms