Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms