Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CluQ06890 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CluQ06890 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CluQ06890 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CluQ06890 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CluQ06890 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CluQ06890 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CluQ06890 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CluQ06890 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CluQ06890 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CluQ06890 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CluQ06890 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms