Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cab39Q06138 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms