Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top1Q04750 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms