Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RelaQ04207 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RelaQ04207 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RelaQ04207 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms