Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms