Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col6a2Q02788 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms