Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabpaQ00422 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms