Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas2P97460 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Npas2P97460 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Npas2P97460 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms