Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TgfbiP82198 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TgfbiP82198 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms