Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx4P70452 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx4P70452 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms