Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh10P70408 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms