Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msx3P70354 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msx3P70354 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms