Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actg1P63260 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actg1P63260 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms