Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3aP63011 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab3aP63011 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms