Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eif3eP60229 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms