Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm2P58774 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms