Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtnsP57757 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtnsP57757 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms