Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnni3P48787 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3P48787 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms