Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx2P48031 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms