Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CratP47934 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CratP47934 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CratP47934 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CratP47934 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CratP47934 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CratP47934 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms