Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms