Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ly6dP35459 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ly6dP35459 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms