Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp12P34960 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp12P34960 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms