Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms