Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa2P31245 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms