Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tacr1P30548 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms