Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RxraP28700 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxraP28700 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxraP28700 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxraP28700 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxraP28700 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxraP28700 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxraP28700 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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