Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZfaP23607 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms