Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3aP23116 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eif3aP23116 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms