Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd3eP22646 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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