Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PdgfaP20033 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PdgfaP20033 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms