Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Selenbp1P17563 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Selenbp1P17563 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms