Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp53P15975 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp53P15975 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp53P15975 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp53P15975 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms