Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fv4P11370 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fv4P11370 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms