Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms