Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna9P09235 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna9P09235 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna9P09235 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna9P09235 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna9P09235 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna9P09235 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna9P09235 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna9P09235 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna9P09235 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna9P09235 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna9P09235 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms