Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa4P06728 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms