Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06321 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06321 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06321 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06321 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06321 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06321 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06321 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06321 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06321 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms