Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P04214 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P04214 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P04214 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P04214 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P04214 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04214 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04214 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04214 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04214 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04214 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04214 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04214 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04214 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04214 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms