Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxq1O70220 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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