Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FiglaO55208 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FiglaO55208 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FiglaO55208 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms