Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp100O35892 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sp100O35892 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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